تعارض مصوبههای هیئت وزیران درباره پالایشگاهها با قوانین بالادستی و ابهامهای موجود در مفاد آنها، از منظر حقوقی زمینه اعتراض در دیوان عدالت اداری را فراهم کرده است؛ در عین حال، این مصوبهها میتوانند بر سودآوری شرکتهای پالایشی نیز اثر بگذارند.
